比如，对大气污染物、水污染物，环保税法沿用了现行的污染物当量值表，并按照现行的方法以排放量折合的污染当量数作为计税依据。“严峻的生态环境形势已经敲响了警钟，从经济、法律或者两者叠加的方面入手开展环保工作刻不容缓。
政府通常会依据项目的可用性(“可用性付费”)、使用量(“使用量付费”)和绩效(“绩效付费”)中的一个或付费。指南还明确规定：“政府有支付义务的，项目实施机构应根据项目合同约定的产出说明，按照实际绩效直接或通知财政及时足额支付……未达到约定标准的，项目实施机构应执行项目合同约定的惩处条款或救济措施。
在解释环境保护税的作用机理时，西安交通大学经济与金融学院王赟杰说：“环境保护税之所以能够减少污染物排放，主要是通过环境保护税调节污染物排放者的行为来实现的。这样‘一奖一罚’，就能够有效地调节纳税人的排污行为，终减少污染物的排放。
其二是明确了排污单位主体责任，要求其按证排污、依法开展自行监测记录、定期执行报告、公开相关信息，采取有效措施防止、减少水污染，并依法承担责任。与此同时，在郑功成委员看来，草案对现行法律做了较大的修正，规制更严格，可操作性与执行力也得到了增强。
